Esta fiscalía tiene como objetivo primordial la competencia para la investigación y ejercicio de la acción penal pública en todos aquellos casos donde se verifique violaciones a los Derechos Humanos de las personas en todo el territorio nacional.

No se enmarcarán dentro de las atribuciones de La FEDH, los hechos constitutivos de delitos en materia de Derechos Humanos, cuando esto hubieren sido perpetrados por particulares, estos casos serán conocidos por los despachos fiscales correspondientes.

La FEDH, además de los principios y valores generales que rigen la función fiscal y se determinan en el Reglamento Especial de la Dirección de Fiscalías, deberá observar en todos los procedimientos administrativos, investigativos y judiciales los principios de especialidad e igualdad que rigen en materia de protección a los derechos humanos contra las violaciones que pudiesen cometer los servidores, funcionarios y/o empleados públicos, actuando en el ejercicio de sus funciones.